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Certaines démos exigent des privilèges supplémentaires, comme l'accès au disque dur local. Une boîte de dialogue de sécurité indiquera l'origine de chacune de ces applications, telle que déterminée par sa signature numérique. L'application ne s'exécute que si on décide de faire confiance à son fournisseur.

Les liens qui lancent les applications sont en fait des liens HTML standard. Cependant, plutôt que de pointer vers une autre page Web, ils donnent accès à un fichier spécial de configuration appelé fichier JNLP. Le navigateur Web identifie l'extension ou le type MIME du fichier, et détermine qu'il est associé à Java Web Start. Il lance alors Java Web Start en lui fournissant en argument le fichier JNLP téléchargé. Java Web Start télécharge, met en cache puis exécute l'application selon les instructions du fichier JNLP.

Le gestionnaire d'applications est intégré au produit Java Web Start. Il permet de lancer rapidement et facilement des applications préalablement exécutées par Java Web Start. Il combine un menu historique et un menu Démarrer/Programmes pour les applications fondées sur la technique Java et déployées à partir du Web. Le gestionnaire d'applications permet aussi de se connecter à la page d'accueil d'une application et d'afficher des informations supplémentaires la concernant.

Pour lancer une application à partir du gestionnaire d'applications, on double-clique sur l'icône correspondante ou on clique sur le bouton de lancement.

Autre fonctionnalité du gestionnaire d'applications, la boîte de dialogue des préférences permet d'examiner et de modifier les paramètres utilisés par Java Web Start. Par exemple, certains onglets permettent de :

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